Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRE11P49959 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRE11P49959 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRE11P49959 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms