Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF6P49848 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAF6P49848 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAF6P49848 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF6P49848 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF6P49848 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF6P49848 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms