Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GSK3BP49841 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms