Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP4P49662 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP4P49662 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP4P49662 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP4P49662 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP4P49662 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP4P49662 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP4P49662 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms