Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRIM1P49642 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms