Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCLMP48507 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCLMP48507 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCLMP48507 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms