Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA4P48058 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms