Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP5P45974 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP5P45974 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP5P45974 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP5P45974 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP5P45974 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP5P45974 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP5P45974 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP5P45974 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP5P45974 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP5P45974 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms