Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms