Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH1P40925 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH1P40925 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDH1P40925 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDH1P40925 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDH1P40925 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDH1P40925 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH1P40925 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH1P40925 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH1P40925 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms