Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms