Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.71□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.71□□□□□ -2.14
VFA1P40080 SLI15YBR156C 2097 nt1.71□□□□□ -2.14
VFA1P40080 JLP2YMR132C 627 nt1.7□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YLL007CYLL007C 1998 nt1.7□□□□□ -2.14
VFA1P40080 COG4YPR105C 2586 nt1.69□□□□□ -2.14
VFA1P40080 TRM3YDL112W 4311 nt1.69□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YCS4YLR272C 3531 nt1.69□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 MEC1YBR136W 7107 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YDR521WYDR521W 336 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 GPG1YGL121C 381 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YPR092WYPR092W 306 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YBR174CYBR174C 315 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 NPR2YEL062W 1848 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 ALK1YGL021W 2283 nt1.68□□□□□ -2.14
VFA1P40080 MYO2YOR326W 4725 nt1.67□□□□□ -2.14
VFA1P40080 FIG2YCR089W 4830 nt1.67□□□□□ -2.14
VFA1P40080 IFH1YLR223C 3258 nt1.67□□□□□ -2.14
VFA1P40080 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.67□□□□□ -2.14
VFA1P40080 RAD50YNL250W 3939 nt1.67□□□□□ -2.14
VFA1P40080 UFD2YDL190C 2886 nt1.67□□□□□ -2.14
VFA1P40080 IRA1YBR140C 9279 nt1.67□□□□□ -2.14
VFA1P40080 MON2YNL297C 4911 nt1.66□□□□□ -2.14
VFA1P40080 PKH3YDR466W 2697 nt1.66□□□□□ -2.14
VFA1P40080 PKH2YOL100W 3246 nt1.66□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YJL022WYJL022W 309 nt1.66□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.66□□□□□ -2.14
VFA1P40080 ALY2YJL084C 3141 nt1.65□□□□□ -2.14
VFA1P40080 YGL217CYGL217C 342 nt1.65□□□□□ -2.15
VFA1P40080 YHR210CYHR210C 1026 nt1.65□□□□□ -2.15
VFA1P40080 BLI1YKL061W 342 nt1.65□□□□□ -2.15
VFA1P40080 COF1YLL050C 432 nt1.65□□□□□ -2.15
VFA1P40080 SAC3YDR159W 3906 nt1.65□□□□□ -2.15
VFA1P40080 VPS15YBR097W 4365 nt1.64□□□□□ -2.15
VFA1P40080 CTF4YPR135W 2784 nt1.64□□□□□ -2.15
VFA1P40080 VPS55YJR044C 423 nt1.64□□□□□ -2.15
VFA1P40080 SGF11YPL047W 300 nt1.64□□□□□ -2.15
VFA1P40080 SEC5YDR166C 2916 nt1.64□□□□□ -2.15
VFA1P40080 CAT8YMR280C 4302 nt1.64□□□□□ -2.15
VFA1P40080 ADR1YDR216W 3972 nt1.64□□□□□ -2.15
VFA1P40080 MCM10YIL150C 1716 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 KAP122YGL016W 3246 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 PBY1YBR094W 2262 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 snR74snR74 88 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 PFD1YJL179W 330 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 RRT15YLR162W-A 189 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 YBR206WYBR206W 324 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 SLX4YLR135W 2247 nt1.63□□□□□ -2.15
VFA1P40080 DNF3YMR162C 4971 nt1.62□□□□□ -2.15
VFA1P40080 APQ12YIL040W 417 nt1.62□□□□□ -2.15
VFA1P40080 YOR302WYOR302W 78 nt1.62□□□□□ -2.15
VFA1P40080 YOR376WYOR376W 369 nt1.62□□□□□ -2.15
VFA1P40080 SMC4YLR086W 4257 nt1.62□□□□□ -2.15
VFA1P40080 NCA2YPR155C 1851 nt1.6□□□□□ -2.15
VFA1P40080 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
VFA1P40080 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.59□□□□□ -2.15
VFA1P40080 YLR422WYLR422W 5799 nt1.58□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YLL054CYLL054C 2532 nt1.58□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YDL206WYDL206W 2289 nt1.58□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YLR140WYLR140W 327 nt1.58□□□□□ -2.16
VFA1P40080 snR14snR14 160 nt1.58□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.58□□□□□ -2.16
VFA1P40080 PAN2YGL094C 3348 nt1.58□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.57□□□□□ -2.16
VFA1P40080 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.57□□□□□ -2.16
VFA1P40080 MMS4YBR098W 2076 nt1.57□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YKU70YMR284W 1809 nt1.56□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.56□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.56□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YOR019WYOR019W 2193 nt1.56□□□□□ -2.16
VFA1P40080 PIP2YOR363C 2991 nt1.56□□□□□ -2.16
VFA1P40080 CCH1YGR217W 6120 nt1.55□□□□□ -2.16
VFA1P40080 BST1YFL025C 3090 nt1.55□□□□□ -2.16
VFA1P40080 AHC1YOR023C 1701 nt1.55□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.55□□□□□ -2.16
VFA1P40080 PMD1YER132C 5262 nt1.54□□□□□ -2.16
VFA1P40080 ECM12YHR021W-A 456 nt1.54□□□□□ -2.16
VFA1P40080 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.54□□□□□ -2.16
VFA1P40080 TRM732YMR259C 4263 nt1.54□□□□□ -2.16
VFA1P40080 AIM44YPL158C 2277 nt1.54□□□□□ -2.16
VFA1P40080 SLD3YGL113W 2007 nt1.53□□□□□ -2.16
VFA1P40080 PAM16YJL104W 450 nt1.53□□□□□ -2.16
VFA1P40080 NUP192YJL039C 5052 nt1.52□□□□□ -2.17
VFA1P40080 ISD11YER048W-A 285 nt1.51□□□□□ -2.17
VFA1P40080 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.51□□□□□ -2.17
VFA1P40080 SWI4YER111C 3282 nt1.5□□□□□ -2.17
VFA1P40080 YAR009CYAR009C 3591 nt1.5□□□□□ -2.17
VFA1P40080 CDC31YOR257W 486 nt1.5□□□□□ -2.17
VFA1P40080 MDS3YGL197W 4464 nt1.5□□□□□ -2.17
VFA1P40080 PET127YOR017W 2403 nt1.5□□□□□ -2.17
VFA1P40080 FIG4YNL325C 2640 nt1.5□□□□□ -2.17
VFA1P40080 OLI1Q0130 231 nt1.49□□□□□ -2.17
VFA1P40080 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.49□□□□□ -2.17
VFA1P40080 YNL337WYNL337W 255 nt1.49□□□□□ -2.17
VFA1P40080 SET3YKR029C 2256 nt1.49□□□□□ -2.17
VFA1P40080 EST2YLR318W 2655 nt1.47□□□□□ -2.17
VFA1P40080 POL5YEL055C 3069 nt1.47□□□□□ -2.17
VFA1P40080 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.47□□□□□ -2.17
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