Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGAEP38570 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGAEP38570 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms