Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM23P36406 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM23P36406 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms