Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN4AP35499 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN4AP35499 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms