Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms