Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNB1P35222 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms