Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF4P34130 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF4P34130 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF4P34130 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF4P34130 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF4P34130 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms