Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG3P32926 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG3P32926 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG3P32926 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms