Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP2P32456 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP2P32456 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms