Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIBADHP31937 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIBADHP31937 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIBADHP31937 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIBADHP31937 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIBADHP31937 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIBADHP31937 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIBADHP31937 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms