Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPS1P31327 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPS1P31327 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CPS1P31327 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CPS1P31327 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPS1P31327 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms