Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD1P29536 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms