Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP1P28562 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms