Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms