Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARK3P27448 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MARK3P27448 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARK3P27448 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms