Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB2P26583 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms