Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNCP24821 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNCP24821 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNCP24821 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNCP24821 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNCP24821 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms