Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRGP23470 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
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