Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms