Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1P21675 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1P21675 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1P21675 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1P21675 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1P21675 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1P21675 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms