Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4AP20648 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms