Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGCP20142 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGCP20142 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGCP20142 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGCP20142 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGCP20142 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGCP20142 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGCP20142 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGCP20142 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms