Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM21P19474 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms