Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARF4P18085 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARF4P18085 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARF4P18085 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARF4P18085 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARF4P18085 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARF4P18085 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARF4P18085 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARF4P18085 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARF4P18085 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms