Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXB4P17483 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms