Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms