Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNAT1P11488 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNAT1P11488 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms