Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMC1P11047 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms