Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRFP10586 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms