Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC192P0DO97 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms