Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAA1P0DJI8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA1P0DJI8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms