Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms