Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIL1P09327 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIL1P09327 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIL1P09327 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIL1P09327 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIL1P09327 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIL1P09327 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VIL1P09327 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VIL1P09327 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms