Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP3P08254 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP3P08254 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP3P08254 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP3P08254 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP3P08254 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP3P08254 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP3P08254 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms