Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB1P08034 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB1P08034 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB1P08034 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJB1P08034 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms