Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT18P05783 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT18P05783 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT18P05783 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT18P05783 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT18P05783 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT18P05783 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT18P05783 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT18P05783 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT18P05783 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms