Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC3P02656 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC3P02656 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC3P02656 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC3P02656 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms