Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms