Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MBD4O95243 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MBD4O95243 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD4O95243 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD4O95243 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD4O95243 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms